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Usando a ferramenta Blast, foi possível encontrar no genoma sequenciado de P. aeruginosa, uma sequência de DNA com homologia significativa com o gene algC de P. aeruginosa (envolvido na biossíntese de alginato) (ver mais). A ferramenta ORF Finder permitiu definir a grelha de leitura aberta, que foi então designada ORF540.
A pesquisa de homologia entre a sequência de aminoácidos da hipotética proteína codificada por ORF540 e as sequências de proteínas e genes depositados em bases de dados acessíveis através do National Center for Biotechnology Information (NCBI) através do uso da ferramenta Blast mostrou que a proteína ORF540 possui homologia significativa com proteínas da família das fosfohexomutases, principalmente com proteínas da subfamília MRSA (methicillin resistant Staphylococcus aureus). Em particular, verificou-se que a sequência de aminoácidos da ORF540 é 82% idêntica e 90% similar à proteína MRSA de Pseudomonas syringae.
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