Gil Poiares-Oliveira

Gil Poiares-Oliveira

Técnico de Bioinformática

INESC-ID

BioData.pt | ELIXIR Portugal

Bem-vindos!

Interesso-me por conjugar abordagens experimentais e computacionais de forma a compreender melhor o funcionamento de sistemas biológicos complexos e descobrir formas novas de combater doenças graves.

Descarregar o meu CV.

Interesses
  • Biotecnologia Médica
  • Biologia de Sistemas
  • Epigenética e Biologia do RNA
  • RNA-Seq
Formação

  • Mestrado em Biotecnologia, 2022

    Universidade NOVA de Lisboa

  • Licenciatura em Biologia (Biologia Molecular e Genética), 2019

    Universidade de Lisboa

  • Minor em Informática, 2019

    Universidade de Lisboa

Publicações

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João R. C. Ramos, José Pinto, Gil Poiares-Oliveira, Ludovic Peeters, Patrick Dumas, Rui Oliveira (2023). Deep Hybrid Modeling of a HEK293 Process: Combining Long Short-Term Memory (LSTM) Networks with First Principles Equations. Authorea.

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Cláudia Noronha-Estima, Madalena Marques, Gil Poiares-Oliveira, Ana Espada de Sousa, Margarida Gama-Carvalho (2023). Dissecting the Role of miR-34c-5p in Human CD4+ T Cells .

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Cláudia Noronha-Estima, Madalena Marques, Gil Poiares-Oliveira, Ana Espada de Sousa, Margarida Gama-Carvalho (2023). Dissecting the Role of miR-34c-5p in Human CD4+ T Cells .

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João R. C. Ramos, Gil Poiares-Oliveira, Patrick Dumas, Rui Oliveira (2022). Genome-scale modeling of Chinese hamster ovary cells by hybrid semi-parametric flux balance analysis. Bioprocess and Biosystems Engineering.

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Gil Poiares-Oliveira (2022). Development of a HEK293 Cell-line Digital Twin Based on Hybrid Semi-Parametric Modeling at the Genome-Scale.

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Gil Poiares-Oliveira (2022). Development of a HEK293 Cell-line Digital Twin Based on Hybrid Semi-Parametric Modeling at the Genome-Scale.

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Gil Poiares-Oliveira (2022). Development of a HEK293 Cell-line Digital Twin Based on Hybrid Semi-Parametric Modeling at the Genome-Scale.

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Experiência

 
 
 
 
 
INESC-ID - Instituto Nacional de Engenharia de Sistemas e Computadores, Investigação e Desenvolvimento em Lisboa
Técnico Superior Especializado - Bioinformática
INESC-ID - Instituto Nacional de Engenharia de Sistemas e Computadores, Investigação e Desenvolvimento em Lisboa
jun. 2023 – Presente Lisboa, Portugal
No INESC-ID, eu trabalho para o BioData.pt como técnico de bioinformática para a área de gestão de dados. Eu suporto programas europeus e nacionais para gestão de dados, mantenho recursos computacionais para formandos e efetuo análises e pipelines de bioinformática. Sou o vice-coordenador de nó do ELIXIR para Portugal com responsabilidades sobre o treino e gestão de dados.
 
 
 
 
 
Estagiário de Investigação
BioISI - Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas
set. 2022 – mai. 2023 Lisboa, Portugal
Researcher at the RNA Systems Biology lab
 
 
 
 
 
Investigador de Mestrado / Bolseiro de Investigação
NOVA School of Science & Technology
jan. 2021 – jul. 2023 Caparica, Portugal
Bolseiro de investigação no Departamento de Investigação da NOVA School of Science and Technology | FCT NOVA, no grupo de Engenharia e Biologia de Sistemas. Realiza investigação em modelação híbrida semiparamétrica do crescimento de culturas de células humanas para produção de vacinas.
 
 
 
 
 
Investigador de Mestrado
Instituto de Medicina Molecular João Lobo Antunes
ago. 2020 – dez. 2020 Lisboa, Portugal
Student researcher at the Institute for Molecular Medicine (iMM) studying the influence of R-loops in mRNA splicing and the correction of splicing defects at the Sérgio de Almeida Laboratory.
 
 
 
 
 
Membro da Direção
AEFCL - Associação dos Estudantes da Faculdade de Ciências de Lisboa
out. 2017 – mai. 2019 Lisboa, Portugal
Member of the Pedagogics and Education Policy Department at the FCUL students’ union. Organized the college’s job fair in 2018 and 2019 as well as various training workshops. Collaborated in various national educational policy motions. Represented the college’s students in local and national forums. Managed the departmental activities and budget (as coordinator).
 
 
 
 
 
Membro do Departamento de Gestão de Projetos (Ciências da Vida)
Júnior Empresa Ciências
out. 2017 – mar. 2018 Lisboa, Portugal
Worked on an app that gathers information of the FCUL campus’ fauna and flora. Responsible for mapping and gathering information regarding the flora.
 
 
 
 
 
Estagiário
Instituto Superior Técnico
jun. 2014 – jun. 2014 Porto Salvo, Portugal
Short term internship as part of a high school protocol. Worked in the Stem Cell Bioengineering and Regenerative Medicine Laboratory learning about laboratory procedures such as human stem cell culture and fluorescence microscopy analysis.
 
 
 
 
 
Estagiário
Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa
jan. 2014 – jul. 2016 Lisbon, Portugal
Research project for a high school subject which involved studying recombinant endolysins biosynthesis and study. In collaboration with the Enzymology group of the Centre for Chemistry and Biochemistry.

📚 Formação

Ações de formação e certificações não conferentes de grau

COVID-19: técnicas de colheita, métodos de deteção e medidas de proteção
National Institute of Health Dr. Ricardo Jorge and the Portuguese Red Cross dez. 2022 – dez. 2022
Colheita de amostras biológicas através de zaragatoa nasofaríngea, técnicas de deteção de SARS-CoV-2 e medidas de proteção para profisssionais de saúde em contacto com casos suspeitos de COVID-19. Curso obrigatório por Lei para profissionais de saúdes envolvidos na testagem de COVID-19.
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Learn C
Codecademy jun. 2022 – jun. 2022
Curso introdutório de 15 h acerca da linguagem de programação C.
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Learn R
Codecademy jan. 2021
Curso de 20 h acerca da linguagem de programação R e o seu uso na ciência de dados
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Entrepeneurship by NOVATechShip
NovaTechShip jan. 2021
Provavelmente o maior evento de empreendedorismo na Europa.
Entry Level Bioinformatics Course
Calouste Gulbenkian Foundation jan. 2020
Curso de introdução a ferramentas analíticas na área da genómica.
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4 Ways 4 the Future
Unlimited Future fev. 2019
Série de 4 workshops: Curiosidade, Comunicação, Gestão de conflitos & Inteligência emocional
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Public Speaking Course
Speak and Lead mai. 2017
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Competências

Linguagens de computação

Python, MATLAB, R, Javascript, C, HTML, CSS, MySQL, Markdown, LaTeX, Bash/zsh

Biologia de Sistemas

Modelação híbrida, análise de fluxos metabólicos, modelação à escala genómica, modelação à base de constrições, modelação dinâmica

Biologia Molecular

Culura microbiológica, cultura de células animais (HEK293, U2OS), clonagem molecular, PCR, extração de DNA e RNA, eletroforese, qPCR (principiante), técnicas de laboratório em BSL-2, ferramentas de bioinformática

Computação

Programação orientada a objetos, inteligência artificial, aprendizagem profunda, redes neuronais artificiais, redes de computadores, desenvolvimento web, git, software gráfico, terminal *nix, Windows, macOS, GNU/Linux

Apoio à investigação

Organização de conferências científicas, comunicação de ciência

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